空管学院硕士专业设有4个：交通运输规划与管理（学术型）、交通信息工程及控制（学术型）、载运工具运用工程（学术型）、交通运输（专业型）。

交通运输规划与管理（学术型）

下设两个研究方向：空中交通管理、航空运行管理。培养目标要求掌握交通运输工程扎实基础理论和系统专业知识，具有合理的知识及能力结构。注重知识、能力、素质等方面的协调发展和创新能力的培养，使学生成为民航交通运输规划和管理的高水平专业人才。

交通信息工程及控制（学术型）

下设三个研究方向：空中交通信息工程、民航系统建模与仿真技术、民航运输信息系统。主要研究交通信息的采集、传输、处理与控制的基本理论和电子、通信、信息与控制技术在交通运输工程中的应用。培养方案旨在以满足国际民航组织（ICAO）制定的相关民航技术标准为基础，实现科研成果与产业应用良好结合，推动民航信息领域技术的发展，提高民航运行效率。

载运工具运用工程（学术型）

下设两个研究方向：飞行技术与航空运行、现代导航理论与应用。培养目标旨在研究掌握现代民航运输机飞行训练安全理论及技术、飞行运行性能、正常与应急飞行程序、卫星导航技术及应用、机载管理计算机及导航数据库技术等内容。

交通运输（专业型）

下设三个研究方向：空中交通管理、航空运行控制、综合交通运输技术。培养目标旨在培养交通运输工程领域具有国际化视野的应用型、复合型的高层次工程技术、设计规划和运行管理人才。